В качестве лекарственного сырья используются корни растения. В процессе заготовки в земле оставляют 30% корневища для восстановления. Собранные корни чистят, промывают, подвяливают, режут и сушат. Хранится, как правило, не более 3 лет. Применяется как противовоспалительное средство. Алтей входит в состав препаратов для облегчения отхождения мокроты при заболеваниях дыхательных путей.